使用炭化炉前，应先打开风机向外排烟，便于炉内点火。炭化炉点火点着火后，应关闭点火孔门并用泥封住缝隙，防止氧气进入炭化机。风机电机工作约8小时，炭化完成后关闭风机。炉子冷却一天半到两天（一天24小时）。自燃式炭化炉的炭化工作基本3天可完成。
自燃式炭化炉的操作：
首先，将树枝或木屑压块机放入炉内。放入木棒时，最好使用铁架并垂直放置于炉内。然后用泥浆密封炭化炉门周围。关门后点燃点火孔。立式炭化炉上有两个点火孔，每个孔倒入2公斤炭火，然后打开风机。五分钟后，关闭两个点火孔。再等四小时，然后关闭风机。检查炭化机点火口周围是否有漏气。如有，必须设法封住。
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如果炭化炉没有漏气，继续打开风机。此时炭化炉上部已有温度，用手可感觉到。这样每隔三四小时检查一次。如有漏气，应封住。直到炭化温度到达放置木棒的炭化炉底部。然后观察炭化炉的烟气。如果烟气呈蓝色透明，可停止风机，表明炉内的木棒已炭化。
然后关闭烟囱（不允许空气进入），再检查点火口周围是否有漏气。关键是防止漏气（注意：如有漏气，炉内木炭可能烧成灰烬）。当炭化机冷却约20小时，炉表面无温度且炉内温度降至60度时，即可出炭。炭化6小时，加上预热和冷却时间共30小时。自燃式炭化炉每次炭化可生产1.5至1.8吨木炭。
